重庆理工大学学报(自然科学) ›› 2020, Vol. 34 ›› Issue (11): 215-223.doi: 10.3969/j.issn.1674-8425(z).2020.11.029

• 药学·生物工程 • 上一篇    下一篇

基于3D-QSAR和分子对接设计新型缺氧诱导因子脯氨酸羟化酶结构域蛋白1抑制剂

储 涵1,何华玉2,何清秀1,王 娟1,林治华1   

  1. 1.重庆理工大学药学与生物工程学院,重庆 400054;2.重庆市九龙坡区妇幼保健院,重庆 400030
  • 收稿日期:2020-06-24 出版日期:2020-12-22 发布日期:2020-12-22
  • 作者简介:储涵,男,硕士研究生,主要从事靶向药物设计研究,E-mail:hamchuan@qq.com;通讯作者林治华,男,博士,教授,主要从事靶向药物设计与活性评价研究,E-mail:zhlin@cqut.edu.cn。
  • 基金资助:
    重庆市自然科学基金重点项目(cstc2018jcyjAX0683;cstc2015jcyjBX0080)

  • Received:2020-06-24 Online:2020-12-22 Published:2020-12-22

摘要: 选择了44个1,2,4三唑[1,5a]吡啶类化合物,利用CoMFA和CoMSIA模型进行了3DQSAR研究。结果表明:CoMFA(n=7;q2 =0712;r2 =0.969)和CoMSIA(n=10;q2 =0754;r2=0.985)具有良好的稳定性和可预测性。随后,应用分子对接方法研究了活性位点的关键氨基酸和配体分子的对接模式。通过分析空间场、疏水场、静电场和氢键受体场的等势图以及对接模型,确定了该类化合物的改造和修饰区域,设计了8个新的1,2,4三唑[1,5a]吡啶类化合物,并预测了它们的活性。结果表明:这些化合物具有良好的预测活性和对接得分,尤其是化合物21g,可作为先导化合物进一步研究。研究结果为发现和设计新的PHD1抑制剂提供了参考。

中图分类号: 

  • R914.2