重庆理工大学学报(自然科学)

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基于粒子群算法的基因表达谱聚类分析方法

李梁,陈佳瑜   

  • 出版日期:2017-02-25 发布日期:2017-02-25

  • Online:2017-02-25 Published:2017-02-25

摘要: 双向聚类算法可以发现基因表达谱中隐藏的信息。为了寻找规模较大的基因相似 矩阵,结合粒子群算法强大的搜索能力,提出了GPCluster双向聚类算法。基于粒子群(PSO) 算法,引入Sigmoid函数进行动态调整,并在粒子飞行过程中加入了遗传算法(GA)“优胜劣汰” 的思想,增加粒子运动的多变性和随机性,避免算法陷入局部最优。实验结果证明:相比GA算 法和PSO算法,改进后的混合粒子群算法GPCluster能找到质量更佳的双向聚类,取得更好的 聚类效果。