重庆理工大学学报（自然科学）

重庆理工大学学报（自然科学） ›› 2019, Vol. 33 ›› Issue (8): 190-197.doi: 10.3969/j.issn.1674-8425(z).2019.08.030

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甜菜夜蛾核多角体病毒VP39基因的克隆与生物信息学分析

李赛男,李 萌,赵海洲,姜玉霞   

  1. 肇庆学院 生命科学学院, 广东 肇庆 526061
  • 收稿日期:2019-01-16 出版日期:2019-09-27 发布日期:2019-09-27
  • 作者简介:李赛男,女,博士,副教授,主要从事微生物分子生物学研究,E-mail:lisainan2001@sina.com.cn?
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(31501705);广东省自然科学基金资助项目(2014A030313664)

  • Received:2019-01-16 Online:2019-09-27 Published:2019-09-27

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摘要： VP39 是杆状病毒核衣壳主要结构蛋白基因,为研究 VP39 在杆状病毒生活周期中的可能作用,用 PCR 方法克隆得到甜菜夜蛾核多角体病毒( Spodoptera exigua multicapsid nucle opolyhedrovirus,SeMNPV) VP39 全长基因( Sevp39),将其克隆至 pMD18 T载体上,获得重组质粒T Sevp39,进行序列测定和生物信息学分析。序列测定结果表明:扩增序列大小为981bp,与GenBank 登录序列(Genbank accession No. NC_002169)核苷酸同源性 99.9% ,第 308 位的碱基由G突变成T。序列分析表明:Sevp39 编码蛋白(Sevp39)有多个可能的N糖基化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和蛋白激酶 C 磷酸化位点,1 个酪氨酸激酶磷酸化位点和 1 个 N豆蔻酰化位点。蛋白序列比对结果表明:Sevp39 与绝大部分杆状病毒 VP39 的序列相似性均大于 30% ,在Sevp39 同源蛋白中有6个高度保守的半胱氨酸残基( Cys)。蛋白质二级结构预测结果显示:Sevp39 可能形成7个α螺旋和14 个β折叠,高度保守的Cys17参与了β折叠的形成。上述结果为研究 Sevp39 在病毒入侵和病毒复制过程中所担负的功能奠定了实验基础。

关键词: 甜菜夜蛾核多角体病毒, Sevp39, 克隆, 生物信息学分析

中图分类号: 

  • Q785