重庆理工大学学报（自然科学） ›› 2020, Vol. 34 ›› Issue (4): 66-75.doi: 10.3969/j.issn.1674-8425(z).2020.04.009
李广平，何清秀，郭海琼，王昱璇，林治华，王远强
摘要： 利用与急性呼吸综合征冠状病毒 ２型（ＳＡＲＳ-ＣｏＶ-２）具有高度同源性的人冠状病 毒类木瓜蛋白酶（ｈｕｍａｎｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓｐａｐａｉｎｌｉｋｅｐｒｏｔｅａｓｅ）晶体，对木瓜样蛋白酶（ＰＬｐｒｏ）进行同 源模建，再通过该模建的蛋白对已上市或已进入临床试验的药物运用分子对接的方法进行虚拟 筛选和动力学模拟研究，以找到对 ＳＡＲＳ-ＣｏＶ-２引起的新冠肺炎疾病（ＣＯＶＩＤ-１９）可能具有治疗 作用的药物。经过筛选，共确定了 １１种与 ＳＡＲＳ-ＣｏＶ-２ＰＬｐｒｏ结合较好的候选药物。分子动力 学模拟和结合自由能分析结果表明：疏水性相互作用在候选药物与 ＰＬｐｒｏ的结合过程中具有重 要作用，并且发现替诺福韦艾拉酚胺（Ｔｅｎｏｆｏｖｉｒａｌａｆｅｎａｍｉｄｅ）具有对 ＣＯＶＩＤ-１９治疗的潜力。虚拟筛选是一种快速且经济的药物筛选的方法，用此方法筛选得到的替诺福韦艾拉酚胺可能可以 作为候选药物对 ＣＯＶＩＤ-１９进行治疗。
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